Исходя их этой директивы, специализация портов будет делиться на: нефтегрузы (представители – Одесский и Феодосийский морские порты); наливные химгрузы (МТП Южный); грузы металлургического профиля (Мариупольский, Ильичевский, Керченский, Южный); зерногрузы (Ильичевский, Николаевский, Херсонский); контейнеры (Одесский, Ильичевский).
Прочие морские порты Украины будут развиваться исходя из рыночных изменения грузопотоков и опираясь на наработанную грузовую базу. В эту группу выделены порты Бердянский, Белгород-Днестровский, Евпаторийский, Ялтинский, Октябрьский, Измаильский.
К отдельной группе будут относиться Ренийский и Усть-Дунайский МТП. Эти представители Дунайского морского региона были признаны потенциально убыточными ввиду отсутствия достаточной грузовой базы, и будут отнесены к системе региональной перевалки.