Груз один и тот же. Разница лишь в видах транспорта. Нужно просто правильно заполнить все графы.
Разница будет лишь условиях доставки согласно Инкотермс и названии документов (Они действительно отличаются, морские и воздушные документы совсем разные).
Ну и конечно разница будет в стоимости доставки, что в итоге повлияет на стоимость товара и размер пошлины.